作為一所醫療專業的教育機構，北醫大擁有三所附屬醫院：北醫附設醫院、萬芳醫院和雙和醫院，一校三院所組成的TMU HEALTH SYSTEM，總床數超過三千床，是為臺北都會地區發展最快速的醫療體系。
三家附屬醫院在見、實習訓練上，提供學生完整的設備與空間，以最佳的臨床經驗與多元的執業機會，使北醫大畢業生就業率超過九成。
北醫大一校三院目前擁有四千七百位工作同仁，分別擔任教學、行政與醫療工作等，未來隨著大北醫體系的成長，北醫大的人力需求將大幅提昇，包括醫師、理人員等，在十年內大北醫體系將有兩千五百四十個人力的職缺，是北醫大畢業生就業的保證。
